隶属于BASS的佣兵克里斯(凯文·道尔曼 Kevin Dorman 配音)奉命前往某处洋馆调查武器走私案件,哪知道在那里遇见了国际通缉犯格伦(约翰·德米塔 John DeMita 配音),两人交手数回合之后,格伦夺路而逃。 大学教授瑞贝卡(艾琳·卡希尔 Erin Cahill 配音)正在研究死者复活伤人时间,由此发现了新型病毒的存在,并且迅速研制出了针对这种病毒的解药,哪知道在这个节骨眼上,研究所遭到恐怖分子的袭击,好在关键时刻克里斯赶到了,救出了瑞贝卡。之后,两人同美国总统直属部队DSO的成员里昂(马修·默瑟 Matthew Mercer 配音)汇合,三人发现,格伦真正的目标正是新型病毒,他想要制造一场破坏性极强的生化危机。
高谭市的黑暗势力又开始蠢蠢欲动了,这次是毁了半边脸的“双面人”(汤米•李•琼斯 Tommy Lee Jones 饰)。一次,“双面人”袭击了马戏团,演员迪克(克里斯•奥唐纳 Chris O'Donnell 饰)阻止了“双面人”的阴谋,家人却因此惨遭杀害。 布鲁斯(瓦尔•基尔默 Val Kilmer 饰)收留了迪克,并说服了满腔仇恨的迪克留了下来。因研究计划被拒绝而仇视韦布斯的公司职员爱德华(金•凯瑞 Jim Carrey 饰)成功研究出脑波吸收装置,化身成为“谜语侠”。 “双面人”和“谜语侠”联手破坏高谭市,并通过脑电波吸收装置大量吸收市民的脑电波。蝙蝠侠这次的对手强大得可怕,蝙蝠侠最终能否战胜罪恶?